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《黑客帝国》中的“锡安”为什么进行轮回？
以下是自己的思考，没有楼上那么复杂。
救世主，也就是尼欧，是因为机器帝国创造母体时不得不产生的一个超级用户（或者说是编写错误），机器帝国旗下的母体没有办法删除以及阻止救世主的产生，于是母体内的造物者和先知做了一个决定。
先知引导救世主，然后当机器帝国尝试了多种黑客方法后（例如第一集入侵船长脑袋获取密码等等），终于使用了“暴力破解方式（DDoS）”进攻锡安。然后在锡安必毁，人类必定灭亡的情况下，由造物者和救世主做一个交易。机器帝国毁灭锡安，但是救世主可以选几个男女重建锡安，保证人类种子不会毁灭，而救世主返回源代码，母体重启。
这样既保证了救世主不会因为超级用户的权利过大而影响机器帝国，毕竟母体的存在只是为了“麦田”能够正常运转，机器帝国可以继续和平地控制“麦田”。一直以来机器帝国以及母体的造物者都满足于这种轮回方式。
直到了尼欧这一代，先知与造物者产生分歧，先知不想再进行这样的轮回，于是引导了尼欧进行不同于以往的责任。并且以自身作为赌注，让失控的斯密斯吸收自己，导致斯密斯成长为连机器帝国也控制不了，甚至能够对机器帝国产生威胁的超级AI程序，最终导致机器帝国不得不与尼欧妥协：尼欧让斯密斯入侵，从而让机器帝国知道斯密斯的代码而可以删除斯密斯，而机器帝国则要放过锡安。
从此机器帝国和锡安进入一段不同以往的关系。
关于尼欧的后期的超能力，我是这样理解的。
尼欧作为母体内产生的超级用户，拥有控制母体参数的能力。其他人例如墨菲斯等人，只能通过一定的黑客能力对母体进行一定修改，力气更大，速度更快，神经反射更快等等。但是尼欧可以直接更改母体参数，例如重力参数，冲撞参数等等，产生母体运行后类似超人的效果。
而到后期，尼欧成长为可以通过脑电波控制“乌贼”死机，权限已经由母体内转到真实世界的机器帝国。瞎了以后，他确实是看不到东西的，但是可以感应到和程序有关的代码。
《黑客帝国》有点故意将剧情设置成一种玄之又玄的关系，可能每个人都有不同的理解并且奉为真理，其实只要自己觉得剧情说得通就好了，没必要太过认真计较。不可否认这是一部好电影，因为它引起了人们的对剧情的争论。
黑客帝国4锡安发生了什么
黑客帝国4锡安虽然被发现但是没有被毁，因为锡安就是机器建的，所以机器一直就知道锡安在哪。锡安没被毁是因为没到母体升级的时候，第三部最后结尾要毁灭锡安就是因为到时候了，Neo应该带着异常代码回归源代码了，母体应该进行下一次升级了。
《黑客帝国》是由华纳兄弟公司发行的系列动作片，该片由沃卓斯基兄弟执导，基努·里维斯、凯莉·安妮·莫斯、劳伦斯·菲什伯恩等主演。影片已上映的有三部，为《黑客帝国》、《黑客帝国2：重装上阵》、《黑客帝国3：矩阵革命》。
总体评价
《黑客帝国》系列看起来很有禅理，可惜的是，导演在第一集中开了个绝佳的好头，却并没能把这部影片的二、三集拍得犹如佛陀手中的六道轮回般玄妙无方。
到第二集时，故事已经开始无法自圆其说了，到第三集就更力不从心，导演已经不知道怎样在讲清这么一套复杂的理论的同时又能照顾到电影的商业性了，于是只好拍了一部与前两集风格迥然不同的怪胎电影出来，把禅机和大成本特技生硬地捏到一起。
以上内容参考 百度百科-黑客帝国
《黑客帝国4》结局解析是什么？
首先我们回顾一下黑3的剧情，在黑3中，机器大军最终定位了人类最后的城市“Zion”，并派遣机器大军攻城，具备“自由意志”的人类(Human)与机械大军（the Machine）在锡安（Zion）发生激烈战争。
由于战力相差悬殊，眼看人类就要灭族，救世主尼奥（the One）以彻底清除史密斯变异病毒为条件，要求机器大军撤军，与人类维持和平。尼奥自认为最终与机械达成共识，在母体内部与史密斯发生激烈战斗。
最终尼奥选择了自我牺牲，清除了病毒史密斯，同时，机器大军撤军，锡安得以保留，矩阵承诺带给所有人真相（主要指仍然在矩阵中的未觉醒的人类），母体迎来了耀眼的日出。注意，在这个过程中，尼奥的爱人崔妮蒂也阵亡了。
黑客帝国4讲的是什么故事
看完黑客帝国4，第一感受的确不是很好，但还是会有一种意犹未尽的感觉。
毕竟和前3部的上映已经间隔了太长时间，剧情的衔接难免会有一些断层。这篇文章的回答主要分为2个部分：
1、黑客帝国4剧情主线解析梳理；
2、黑4中部分剧情问题解析；
（1）矩阵还存在吗？为什么矩阵还会继续存在？机器反悔了？
（2）年轻版的墨菲斯从哪来的？
（3）为什么矩阵中的场景会实时反映在尼奥制作的游戏中？
（4）为什么一直找不到尼奥，花了60年？
（5）为什么史密斯可以无视分析师的时间静止能力？
（6）为什么许多程序没在版本迭代中被清理掉？
（7）为什么尼奥很年轻？
引言：黑客帝国的本质就不是商业片，而是包裹了一层商业皮的文艺电影。它的科幻感更多是一种包装，来为沃卓斯基姐妹的世界观保驾护航。
时隔20年的重启，这20年间信息技术发生了革命性的变化，而人类社会因此而生出更多的选择和想法，也与1999年完全不同。这种变化改变了导演，而她真实的想法在这一部中自由地体现了出来。人类靠爱来维系，靠理解来发展进步。一成不变，守旧封建的思想禁锢向前的脚步，所以过去的Zion只能成为历史，执着于曾经传说的墨菲斯也终究成为了过去。
黑客帝国的核心元素从来就不应该是墨镜和黑风衣，还有炫酷的动作设计，这些是附加的漂亮外衣，它内体，如同被粘稠的培养液浸泡着的漂亮躯体，以及所有awake people，他们的选择。从来没有选择，所有的选择都是你以为你有选择，而你早就已经做出了选择，而你需要做的是理解你的选择。这种使命感和归宿感在这一部更为明显得表现出来。崔妮蒂一定会选择相信尼奥，尼奥一定会选择拯救唤醒崔妮蒂。
在影片的中后段，大反派“分析师”（the analyst）终于说出系统复活尼奥与崔妮蒂的目的——用爱发电。两人当年的行动多么轰轰烈烈，对系统造成了不小的伤害，但系统可以反过来利用这种能量。他们把尼奥和崔妮蒂（蒂芙尼）设计成互相倾慕而不可得的关系，让两人之间“爱”的能量永远处于满值却又不溢出（对系统造成危险）的状态、做矩阵的情感劳工——两人如同视频网站上做夸张反应的up主或为女主播刷火箭的观众，连结似有若无，不断生产并维持着能量供系统去驱使利用。
人类和机械，究竟差距在哪呢？人类的智慧创造出了机械，催生出来了人工智能，甚至能够让机器学会思考。机械能够在物理意义上远超过人类，一旦其不再为人类而服务，人类将陷于低生活被反过来奴役的境地，能够拿出来与之决斗的砝码，便只有情感、信仰、希望。这是人类区别于机械的最高级的存在。机械不会有感情，不会相信奇迹，不会有希望，不会有强大的意志力，100%的理性，而进步的变革需要不理智的火花去点燃进程。
1、黑客帝国4剧情主线解析梳理：
首先我们回顾一下黑3的剧情，在黑3中，机器大军最终定位了人类最后的城市“Zion”，并派遣机器大军攻城，具备“自由意志”的人类(Human)与机械大军（the Machine）在锡安（Zion）发生激烈战争。
由于战力相差悬殊，眼看人类就要灭族，救世主尼奥（the One）以彻底清除史密斯变异病毒为条件，要求机器大军撤军，与人类维持和平。尼奥自认为最终与机械达成共识，在母体内部与史密斯发生激烈战斗。
最终尼奥选择了自我牺牲，清除了病毒史密斯，同时，机器大军撤军，锡安得以保留，矩阵承诺带给所有人真相（主要指仍然在矩阵中的未觉醒的人类），母体迎来了耀眼的日出。（注意，在这个过程中，尼奥的爱人崔妮蒂也阵亡了。）
黑4的剧情发生在黑3事件60年之后，时间来到23世纪下半。
黑4开头，还是熟悉的音乐，熟悉的配方
这里很明显是在致敬黑1，崔妮蒂和墨菲斯说过同样的话“You were right”,画面也似曾相识
影片开始，一个黑夜，一名黑衣人像崔妮蒂一样被追杀。
不同的是，更多的黑衣人出现，最终抓住了假崔妮蒂，引来了巴戈斯（Bugs）。（没错，他的名字就叫BUGS，不言而喻。）
一群黑衣特工对巴格斯紧追不舍，
巴格斯逃到一个布满钥匙的房间，这里也是暗示这个房间会有些奇怪的后门。
果然，关键时刻，神秘黑衣特工开后门解救了巴格斯。
这里又是一大段对白以及截图，从这里我们能了解到非常多事。
墨菲斯没死，变成了程序得以保存，而且还通过某种方式覆盖到一个特工程序身上，导致一个特工叛变，这个叛变特工名字叫史密斯。
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（这个黑人小哥亲口承认自己是墨菲斯，再次开始寻找尼奥，外形更加年轻强壮，但是和墨菲斯有几分相似，可以猜测就是年轻状态的墨菲斯，请忽略战五渣翻译）
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可以对比下，外形确实很相似。
（2）尼奥没死
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巴格斯第一眼看到的外形其实并不是尼奥，而是另一个人，暗示尼奥的外形发生了变化，应该是被重新编程了，但是巴格斯说他擅长监听，虽然尼奥此时没有觉醒，仍然受到了救世主的影响发生觉醒。
黑衣特工在巴格斯的劝说下，吃下红色药丸，成为墨菲斯，肉体以拟态的方式存在于现实中。
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最后两人开启水面通道，成功摆脱特工追杀。
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镜头切换，一个长相酷似尼奥的人（姑且继续称他是安德森）在做游戏开发，（似乎还是个VR游戏。）
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可以看到他开发的游戏就是黑客帝国，而且还得了很多奖，游戏最早发布时间就是1999年。
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这时游戏系统忽然出现了BUG,出现BUG的地点刚好就是刚才巴格斯救墨菲斯的地方。这里我们很容易联想到刚才发生的一切是不是只是游戏场景。
之后安德森和同事裘德一起喝咖啡闲聊（这人叫JUDE,和犹大同名，暗示不是啥好货），碰到一个酷似崔妮蒂的人上前搭讪，得知对方叫蒂芙尼，已婚带俩娃，老公叫查得。
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聊完回办公室发现，刚才出BUG的模块消失且被清理。
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之后安德森被老板叫去办公室，聊到第一次见面有种被FBI审讯的感觉，加上闪回，可以推断这个老板就是史密斯。
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这里还同时调侃拍黑4就是因为市场难做，为了骗钱，不管有没有之前的演员都非拍不可- -
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聊完安德森觉得又分不清现实和虚拟世界的边界了，于是去找心理咨询。（这心理咨询师的眼镜都是蓝色的，和蓝色药丸颜色一致，暗示心理咨询师是矩阵系统的组成部分）
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心理咨询师给安德森开了一大瓶蓝色小药丸，嘱咐药不能停。安德森吃了药之后就开始继续无聊的游戏开发生活。
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这句话的大概意思是“埋葬现实比处置梦想要简单的多”
随着游戏开发的深入，安德森对世界越发感到怀疑，开始停药，同时在咖啡馆多次偶遇蒂芙尼。
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大楼偶发事故，让安德森碰到了墨菲斯，安德森对墨菲斯的长相大为震惊，因为和他游戏里编辑的人物长相完全一致。
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大量警察到来，打断了他们的谈话，火拼在所难免。
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换皮史密斯出现，带着标志性动作成功追杀安德森，安德森被系统重置，安插了一段其他的记忆。
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安德森大脑彻底被搞残，在准备尝试飞行（跳楼）之前被赶来的巴格斯救下。
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终于成功救出安德森，安德森再次成为尼奥。
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苏醒后的尼奥发现崔妮蒂没死，而且就在他的培养皿旁边。
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巴格斯带着尼奥回到人类城市IO，见到了老朋友奈奥比
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奈奥比告诉尼奥，黑3之后，大量人类觉醒，机器能源不足，部分机器人觉醒自由意识，内部发生战争。
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同时，墨菲斯高票当选理事会主席，拒绝和机器人建立任何合作，一部分人类认识到仅仅依靠现存力量永远无法打败机器，所以离开了ZION，重新建立了新的城市IO。
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尼奥恳求奈奥比帮助营救崔妮蒂遭到拒绝，于是偷偷和巴格斯联系准备自己去救。
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再次进入矩阵的尼奥刚走两步就遇到了换皮史密斯
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通过对话得知，尼奥的心理医生就是新任矩阵管理员，而史密斯还是想伺机报复矩阵
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史密斯找来一群老熟人，冲突在所难免。这个老熟人就是黑3中搞色情派对的古老程序法国佬
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只不过这货现在衣衫褴褛，似乎穿着他的下属火车人的衣服，或许也就是通过这种方式躲过了系统的清除？
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尼奥一个气功波让史密斯领了便当，其他喽啰应声而退。
终于，尼奥找到了崔妮蒂，但是分析师也同时赶到。
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现在的矩阵有了更可怕的控制力，可以让时间短暂倒退以及静止。
原来当年在尼奥消灭了史密斯之后，矩阵为了研究尼奥和崔妮蒂，治疗好了崔妮蒂和尼奥的伤势，并进行各种折磨。
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后来发现，只有将两个人放在一起，但是又不能相认，这样周而复始就催生欲望和恐惧，这就是人类的本性，就是现实世界最本质的特点，引入这样的机制甚至能推动矩阵完美运行。
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这里还能看到，这个分析师已经不是之前的分析师了。前任被他推翻并干掉了。
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并且这个分析师喜欢使用“集群模式”来维护矩阵稳定，集群和特工是同时存在的，可以看到，集群就是非常多的机器人角色，可以理解为矩阵中的披着人皮的AI,这种人战斗力虽然不强，但是人数众多。
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通过这样的方式促使矩阵完美的运行了很多年，发电量比之前还要高出很多，在培养皿中的人类几乎都不怎么捣乱了，用分析师的说法就是“比猪都快乐”
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简而言之，尼奥和崔妮蒂两个人在一起才能更好的发电并控制人类，如果尼奥不乖乖自己回培养皿，分析师就杀掉崔妮蒂。
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尼奥只能先乖乖的先撤回IO。这时，机器盟友找到了尼奥。
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原来，机器盟友的首领就是先知和上一任总工程师的女儿，她的父母都被现任分析师杀掉了，所以和现任分析师结下了梁子。于是她提出了营救计划，协助一起营救崔妮蒂。
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尼奥再次回到矩阵，恢复了崔妮蒂的记忆。分析师使用时间静止能力打算杀掉所有人
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关键时刻史密斯来找分析师寻仇，一顿操作猛如虎打残了分析师，崔妮蒂成功被救走。
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逃跑的路上遇到大量集群，关键时刻崔妮蒂觉醒了飞行能力救出所有人，全片结束
2、黑4中部分剧情和前作的关联，以及问题解析；
（1）矩阵还存在吗？为什么机器人反悔？
还存在，但已经不是之前的矩阵了。很明显总工程师承诺给人类自由，停止战争，导致机器世界资源紧缺，一部分人心生不满，篡位夺权引发战争，总工程师被杀，矩阵再次运行，而且发电量更大，控制了更多的人类。但是机器世界也发生了分裂，一部分机器和人类结盟。
（2）年轻版的墨菲斯从哪来的？
通过墨菲斯和巴格斯的对话可得知，矩阵应该是通过某种方式保存了老墨菲斯的部分意识，通过清洗利用改造成了特工（矩阵经常干这种事，所以这个猜测很合理），结果很墨菲斯自然觉醒，开始继续一边假扮特工一边寻找尼奥。
（3）为什么矩阵中的场景会实时反映在尼奥制作的游戏中？
我们可以看到，影片开头巴格斯救墨菲斯的地方，和黑客帝国游戏出BUG的地方是一致的。
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而尼奥第一次见墨菲斯的时候大为震惊，因为和他游戏中的角色形象完全一致，这就代表游戏中发生的事情很可能在现实中也发生过。
其实是巴格斯黑了安德森的系统，将这段剧情加入到了安德森的游戏里面，用来告诉安德森实际已经发生的事情。
（4）为什么一直找不到尼奥，花了60年？
因为尼奥在黑客帝国里的映射形象一直在发生变化，包括容貌声音等等，而且这种变化是彻底的，周围人自然的态度会帮助映衬这种变化，所以导致人类很难准确定位尼奥。
（5）为什么史密斯可以无视分析师的时间静止能力？
这里史密斯自己的解释是：“一但尼奥离开了矩阵，我就自由了。”我的理解是史密斯和尼奥类似于杀毒软件和病毒的关系，而且都版本更新很多代，一但尼奥不受矩阵控制，史密斯就可以绕过任何防御程序对其他程序进行感染。
（6）为什么很多程序没有在版本迭代中被清理掉？
首先不要小瞧矩阵的自我净化能力，先知和总工程师这样的人物都可以被清理。
其次，要对机器世界有深刻的理解，机器世界已经进化到每个机器也有自由的思想和意识，每个机器的想法并不都是一样的。
另外，有些程序没有被清理不是系统不想清理，而是很难清理，参考史密斯，可以随便换皮，程序太多了，系统很难定位
最后，有些程序不清理是因为核心代码有用，比如墨菲斯，可以当特工，程序重新写一下就能用。
（7）为什么尼奥很年轻？
因为时间流逝在矩阵里和现实中是不一样的，身体一直泡在那个新发明的培养仓中可以活的更长久。
关于电影《黑客帝国》结局的问题
从这些能看出，你基本没看懂黑客帝国。你没看懂的是黑客帝国的宗教哲理。 那我们就从头开始。 电影里的矩阵不仅是一个虚拟程序，也是一个实际存在的地方。在这里，人类的身体被放在一个盛满营养液的器皿中，身上插满了各种插头以接受电脑系统的感官刺激信号。人类就依靠这些信号，生活在一个完全虚拟的电脑幻景中。机器用这样的方式占领了人类的思维空间，用人类的身体作为电池以维持自己的运行。 在电影中，Matrix是一套复杂的模拟系统程序，它是由具有人工智能的机器建立的，模拟了人类以前的世界，用以控制人类。在Matrix中出现的人物，都可以看做是具有人类意识特征的程序。这些程序根据所附着的载体不同有三类：一类是附着在生物载体上的，就是在矩阵中生活的普通人；一类是附着在电脑芯片上的，就是具有人工智能的机器；这些载体通过硬件与Matrix连接。而另一类则是自由程序，它没有载体，诸如特工、先知、建筑师、梅罗文加、火车人等。 Matrix是一个巨大的网络，连接着无数人的意识，系统分配给他们不同的角色，就象电脑游戏中的角色扮演游戏一样，只是他们没有选择角色的权利和意识。人类通过这种联网的虚拟生活来维持自身的生存需要，但Matrix中的智能程序，也就是先知的角色，发现在系统中有1%的人由于自主意识过强，不能兼容系统分配的角色，如果对他们不进行控制就会导致系统的不稳定，进而导致系统崩溃。因此编写Matrix的智能程序，也就是建筑师就制造了“救世主”，让他有部分自主意识，并成为觉醒人类的领袖，带领他们建造了锡安。 锡安，一词在《圣经》中，是所罗门王建造圣殿所坐落的山，位于圣城耶路撒冷。而在犹太教中，“锡安”代表着上帝的荣耀，是神的救赎来临的标志。当大地被毁灭后，人类将在锡安接受最后的审判。 在电影中，“锡安”是指那些从Matrix中被解放的人类所栖居的家园，位于地球深处，依靠地热作为能源，成为人类对抗Matrix和机器之城的最后基地。电影用这个名字来命名人类的最后家园，象征着这里是正义得到彰显的地方，是对抗机器的圣地。有影迷根据剧情推测：zion 所在的世界其实是另一个母体，是超智能设计的让本身升级的另一套程序。更有人认为，“真实世界”中的zion所在的世界是用来蒙蔽那些觉醒者（占Matrix中人口总数1%的那些人）的一个更接近真实世界的一个更大范围的“母体”，这个所谓的“母体”——zion所在的世界是用来取代影片中的母体的升级版本。 救世主，Matrix是一个建立在数学基础上的严整系统，一切都是有规律的，包括特工们和尼奥的超能力在内，都是包含在这个系统中的。而尼奥这个“救世主”的产生，则和数学中的哥德尔命题有关。奥地利数学家哥德尔在1931年发表了题为《论《数学原理》及有关系统的形式不可判定命题》的论文，其中提出这样一个观点，在任何数学系统中，只要其能包含整数的算术，这个系统的相容性就不可能通过几个基础学派所采用的逻辑原理建立。简单地说，就是在任何系统中，总有些真理是游离于逻辑之外的，这些真理就叫做歌德尔命题。 在Matrix中，尼奥就是在Matrix这个严整系统中不能被数学推得的歌德尔命题，不符合系统的规律。（建筑师对尼奥的谈话中涉及部分）当尼奥重生后，他就担负起系统所有的扰动，所有的规则在他面前都变得透明，因此他能够看到系统中别人所看不到的东西。先知叫尼奥回到源头去终止灾难，在数学逻辑中就是将歌德尔命题变成整个系统的一部分，当作系统的一个变量，从而消除整个系统的不确定性。如果尼奥当初选择了毁灭锡安的门，他所携带的代码将反馈给系统，将系统的稳定性提高到一个新阶段。而这个选择的前提则是系统中没有斯密斯这个狂人。但从数学的角度上来说，这样的稳定也是暂时的，不是对系统的彻底修正，新的系统还是会产生自己的歌德尔命题，从而继续这个轮回。这就是为什么在尼奥之前会有五任救世主的原因。 按照建筑师最初编写救世主时的任务，救世主的使命就是在锡安运行一段时间后，将锡安的代码带回到Matrix的源程序进行重装，同时机器摧毁锡安，完成Matrix系统的升级。之后救世主将按照初始设置，带领16女7男返回真实世界，再开始重建锡安，等待下一代的救世主。而尼奥与前任们不同的是，建筑师在他的意识中编写了关于爱的编码，这本来是系统处于不断升级的需要，也是考察人类反应的新实验。但这个关于爱的编码，不但导致了尼奥在第二集中做出违背程序设置的选择，而且在第三集中将“爱情”升华为“博爱”，从而最后终结了战争，终止了矩阵和锡安之间的循环。 设计师，他是矩阵之父，确切的说是整个机械王国的缔造者，是他编制了“矩阵”这个系统，他是拥有最高智能和权限的机器。他认为一切事物都可以用精密的数学计算和逻辑推理来解释。而“先知”是另一个有最高智慧和极高权限的智能程序，她认为不确定性才是世界的本质，她可以说是比“设计师”拥有更先进思想的智能程序，是她引导NEO成为了救世主，没有她NEO也许会像前几任救世主一样选择进入“矩阵”，完成轮回。而她的目的是谋求机器与人的和平共处。NEO是一个人，他对世界本质的认识比一般人深刻，因此他拥有“超能力”，但是这点超能力对于改变世界来说是微不足道的，所以NEO根本不可能打败机器世界，就像机器人不能消灭人一样。因为机器一旦拥有了智能、独立意识就应该把他看成是一种新的生命形式，是与人平等的生命，如果NEO把机器全部消灭了那就是另一种的屠杀与奴役，是人屠杀了机器。因此片中的结局只能是唯一的结局，人与机器的共存，人与机器都有自由的权利，选择的权利。最终结果只能是——平衡。 特工史密斯 英文中的Smith意思就是铁匠，而他的车牌号是IS 5416，这都暗含着宗教含义。在《圣经·以塞亚书》第54章16节里说到：吹嘘炭火，打造合用的器械的铁匠是我所造；残害人、行毁灭的也是我所造。这正暗指特工史密斯在矩阵系统中的作用——消灭一切危害矩阵运行的异常程序。电影中的特工史密斯实际上就是矩阵这个程序世界中的杀毒程序，他们在矩阵中是没有身体的，由于他们是杀毒程序，所以他们被矩阵赋予了超越常人的能力。在矩阵中他们具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体。 尼奥最后可以战胜特工，实际上是因为他复活后具有了识别矩阵代码的能力，并可以轻松改写这些代码，所以特工就不能再利用超能力战胜他了。 特工史密斯被尼奥消灭后，因为在他被尼奥消灭前明明是他先杀死了尼奥，所以这就导致了一个逻辑错误。因为这种程序上的逻辑运算错误，导致了特工史密斯不但拒绝被系统删除，而且由杀毒程序变成了病毒，最后危害到了整个矩阵世界。 因为这个逻辑错误是由尼奥导致的，所以特工史密斯就变成了和尼奥相对的负极。最后尼奥选择了让史密斯感染自己，在复制过程中矩阵掌握了史密斯的代码，最后才得以将他们两个同时删除，使矩阵回到了平衡。 尼奥死了后，系统恢复到了以前（黑客帝国1的时候），但系统不再升级，机器帝国撤回了机器军队，人类免于毁灭。那么也不再有轮回了。 至于，为什么尼奥能让意识反回距阵，是因为他是救世主，能够超越矩阵，不受系统的约束。而其他人，则是通过传输进入矩阵（就是那些人后脑有个圆形的洞，将传输线插入后，就可使意念进入矩阵）。但他们不能够直接进入。 最后，人类的锡安和平了，那些被作为能源的人将继续活下去，但会拥有自由意识，不会再由系统支配。 /SPAN/p
黑客帝国锡安
是的，第一种说法锡安是梅曲克斯之外的真实世界仅存的唯一一个人类聚集地，是人类反抗军和机器作战的中心区、指挥部（这么像终结者。。），另一种说法锡安只不过是“梅曲克斯2.0”，也是个虚拟的世界，是用来采集那些不能安分守己的被控人类的思想及生活数据，用来完善梅曲克斯系统，让虚拟世界更加真实，也就是说电影中人类奋战到最后仍旧是在虚拟的世界中做梦。
黑客帝国这个电影很完美，可以说毫无漏洞，官方对剧情中的伏笔和要点至今仍没有解读，也就是说是全自由的，没有标准答案，我个人更倾向第二种说法，因为尼奥在所谓的真实世界中曾经用单手集中精神力挡住过机械乌贼，这一点很明显说明了这个有锡安存在的“真实世界”发生的事并不是符合客观事实的，人再怎么集中精神也不可能凭空在物理上阻挡其他物体，但是在虚拟环境中做到这种事简直易如反掌（参考电脑游戏。。。），所以我认为锡安也是虚拟的，“真实世界”只是另一个梅曲克斯，墨菲斯之类的可能还躺在某个发电厂发电，只不过他们这些人跳出了梅曲克斯的第一层虚拟世界，紧接着又掉入了另一个更加复杂更加严谨的第二层虚拟世界，只有这样，搭载救世主程序的尼奥才能激活特权得以在“真实世界”使用精神力攻击和防御，使用精神力在瞎了眼睛的情况下看到被史密斯占用的贝恩的代码轮廓，这种事在现实世界中怎么可能出现，所以，我还是觉得，锡安，是虚拟的。
纯手打，如果还有问题我接着补充